多模态 AI 3D 分子生成
结合专家智慧密度数据,融合化学语言与几何空间的多模态学习框架,以首创阶梯式评估
体系引导模型持续进化,构建更智能、更可靠的分子生成与优化平台

 

 

 

以数据为基石,算法为驱动,以科学评估为保障,

构建高质量分子生成体系

 

结合专家智慧精炼计算化学方法构建数据

融合实验电子密度深度挖掘数据

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融合化学语言与几何空间的多模态

学习框架,生成化学合理且靶点特异的3D分子

  • 吊灯扶桑
     
     
     
     
    电子密度标注独有NCI数据驱动关键片段识别优化
     
    利用基于电子密度数据标注的NCI(非共价相互作用)数据,采用多任务方式预测关键NCI并对其准确性进行判断调整,从而强化模型对关键片段的识别与优化能力。

     

  • 蟹爪兰

     

     

     

    FSMILES 分子语言表征
     
    在传统SMILES分子表征的基础上进行改进开发了FSMILES(片段式的SMILES),在保持表达能力不变的情况下最大程度的压缩了表达方式,同时使得片段中的相关原子可以携带其所在环的整体信息,降低了自回归生成过程的难度。

     

  • 菊芋
     
     
     
     
     
    几何学习方法表征空间构象
     
    引入球坐标系作为相对坐标描述局部构象(键长,键角,二面角),用直接坐标系坐标来描述全局空间信息,从而能够更加精准的客户原子间的空间关系信息

     

  • 榆树
     
     
     
     
    大规模小分子数据预训练
     
    引入了大规模的类药分子的2D拓扑结构及力场级别低能态3D结构进行预训练,使得模型更倾向于生成构象相对合理的分子。

     

  • 郁金香
     
     
     
     
    百万级配体-口袋复合物调优
     
    通过高质量蛋白口袋 - 化合物分子配体复合物调优,模型优先根据口袋条件预测下一个元素类型,再预测能够确定分子构象的内坐标,然后以口袋和内坐标作为条件,预测分子在口袋中的绝对位置,这样的设计降低了预测任务的难度,从而生成匹配口袋形状及相互作用的3D分子。

首创阶梯式评估方法,以工业及标准引导模型迭代

 

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